Depuis le début des années 90, conscient de la beauté et de la fragilité de son territoire, l'agglomération du Boulonnais oeuvre pour protéger et sensibiliser la population locale et les touristes par le biais d'actions diverses et variées.
17 communes de l'agglomération font partie du parc naturel régional des Caps et Marais d'Opale, 5 sites sont sous la protection du Conservatoire du Littoral, et 10 espaces naturels sensibles sont gérés par l'équipe d'Eden 62.